區別如下:
自貿區試行有條件的公司注冊資本認繳登記制，除有規定的企業外，其余試行認繳制，不再登記實收資本，也不提交驗資報告。
自貿區試行有條件的“先照后證”登記制。取得營業執照即可從事一般生產經營活動;申請從事其他許可經營項目的，應當在領取營業執照及許可證或者批準文件后，方可從事經營活動。
自貿區試行企業年度檢驗制度改為企業年度報告公示制度。
自貿區建立經營異常名錄制度。
自貿區試行新的營業執照樣式。
外商投資準入試行負面清單備案制。
外商投資廣告企業試行備案制。
自貿區里注冊公司和自貿區外的區別是什么
自貿區試行有條件的公司注冊資本認繳登記制，除有規定的企業外，其余試行認繳制，不再登記實收資本，也不提交驗資報告。
自貿區試行有條件的“先照后證”登記制。
取得營業執照即可從事一般生產經營活動;申請從事其他許可經營項目的，應當在領取營業執照及許可證或者批準文件后，方可從事經營活動。
自貿區試行企業年度檢驗制度改為企業年度報告公示制度。
自貿區建立經營異常名錄制度。
將未按規定期限公示年度報告或者通過登記的住所(經營場所)無法取得聯系等的企業載入經營異常名錄，并通過市場主體信用信息公示系統向社會公示。
自貿區試行新的營業執照樣式。
外商投資準入試行負面清單備案制。
對外商投資準入特別管理措施列表(負面清單)之外的領域，自貿區內外商投資企業向商務部門或其授權單位備案，并向登記機關申請設立登記。
外商投資廣告企業試行備案制。
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